馬爾巴佛學會的行政團隊為學員中推選出來擔任的義務工作。任期以二至三年輪替。主要負責的工作，包括佛學會場所的日常管理、各班級共修的例行性事務、年度特別活動的專案執行，以及公關宣傳、財務等營運業務。

在行政團隊開會時，通常會先念誦堪布仁波切所開示的〈給佛法中心工作人員的忠告〉然後再進行會議：